在傳統(tǒng)的植物學(xué)研究中，受實驗手段所限只能研究植物表型在某一個時間截面時的靜止?fàn)顟B(tài)，反映的是該時間點以前全部生物學(xué)動態(tài)過程的累積效應(yīng)。然而植物的生長發(fā)育是一系列時間—空間特異的過程的組合，只有觀察動態(tài)變化過程才能更好地認(rèn)識植物生長發(fā)育調(diào)控的時空特異性。而且隨著植物科學(xué)的發(fā)展，越來越多的研究人員需要在活體植株中驗證基因的功能，研究基因的表達(dá)調(diào)控，以及植物的晝夜節(jié)律等，因此，對于植物活體成像的需求也越來越大，還可以應(yīng)用于植物陽性克隆的篩選以及轉(zhuǎn)基因植物的鑒定等多方面。

　　植物活體成像可應(yīng)用于植株，葉片，種子，愈傷組織等熒光和生物發(fā)光成像，可同時顯示多個報告基因，滿足不同熒光探針的檢測需求，如GFP， RFP及紅外染料等，尤其適用于植株體內(nèi)Luc報告基因的檢測。

　　植物基因表達(dá)和蛋白質(zhì)互作研究、抗逆性研究、基因脅迫實驗、生長規(guī)律及節(jié)律監(jiān)測、克隆篩選、基因育種篩選、葉綠素監(jiān)測、藥用植物篩選以及植物細(xì)菌和病毒感染研究等。

　　植物基因表達(dá)和蛋白質(zhì)互作研究

　　植物的基因表達(dá)受到溫度、光照等因素調(diào)節(jié)，能夠直接反映植物基因表達(dá)的空間和時間分布，進(jìn)而了解體內(nèi)特異性基因與受體相互作用和信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑等生物學(xué)過程。

　　葉綠素監(jiān)測，對植物體中葉綠素進(jìn)行定性和定量測定來估算植物的生長狀況及分布，可作為植物和環(huán)境質(zhì)量評估的指標(biāo)。

　　植物生物節(jié)律及光周期相關(guān)研究，生物節(jié)律是一種生物內(nèi)在的、復(fù)雜而精細(xì)的生理調(diào)節(jié)系統(tǒng)，它使植物得以根據(jù)外界環(huán)境的周期性變化來協(xié)調(diào)自身新陳代謝及各種生理過程，從而與環(huán)境保持同步。